Datensicherheit ist die Grundlage für alle Funktionen des WhistleB-Systems.
Das System bietet ein hohes Maß an Informationssicherheit und ermöglicht die Verwaltung personenbezogener Daten und wurde von einer unabhängigen Stelle geprüft. Es ist ISO27001-zertifiziert und nutzt Microsoft Azure als Hosting- und Entwicklungsplattform. Alle Daten werden in der EU gehostet.